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深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布

作者:admin 发布时间:2019-10-08 05:24:19 浏览次数:166
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摘要
【深圳农业基因组研讨所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布】近来,由我国农业科学院深圳农业基因组研讨所猪基因组规划育种立异团队,于BioRxiv在线发布了我国优秀深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布当地猪——陆川猪的高质量基因组序列。该基因组序列的宣布,不只添补了亚洲家猪短少高质量参阅基因组的空白,更为基因组拼装供给了新的方向。(深圳特区报)

  “我国猪”的基因组正走上国际化研讨路途。近来,由我国农业科学院深圳农业基因组研讨所(以下简称“基因组所”)猪基因组规划育种立异团队,于BioRxiv在线发布了我国优秀当地深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布猪——陆川猪的高质量基因组序列。该基因组序列的宣布,不只添补了亚洲家猪短少高质量参阅基因组的空白,更为基因组拼装供给了新的方向。

  我国当地猪群具有丰厚的遗传多样性,是深化发掘猪种肉质质量和抗病力等重要性状优质基因的遗传宝库。但是,跟着西方商业猪种的遍及,本地猪种受到了非常大的冲击,有些闻名当地种类的数量比大熊猫还要稀疏,部分种类乃至现已灭绝,当地猪种质资源的维护刻不容缓。

  通过不懈的尽力与技能攻关,研讨团队终究获得了染色体等级的猪基因组序列,contig N50超过了18Mb,Scaffold N50 超过了140Mb。而且使用最新的拼装算法和Hi-C技能,获得了完好的两套基因组序列。这是基因组研讨范畴的重大突破,为研讨等位基因的功用互作供给了名贵的数据和技能根底。

  “咱们本次拼装得到的深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布猪基因组,除了有很高的连续性外,更是成功地获得了2套染色体等级的基因组序列,这在基因组拼装研讨范畴尚属初次。”项目负责人唐中林研讨员兴奋地说,这意味着能够一起研讨同源染色体的变异,以及来自深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布不同亲本的等位基因功用。

(文章来历:深圳特区报)

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(责任编辑:DF381深圳农业基因组研究所添补一项空白 陆川猪“超清”基因图谱发布)

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